根据国家自然科学基金的资金管理办法，合作单位资金分配主要依据以下原则：
1. 项目获得资助后，甲方和乙方根据各自承担的项目经费额度，分别制作“国家自然科学基金项目资金预算表”及“预算说明书”，并按此预算方案进行资金分配。
2. 间接经费的数额原则上应由双方直接经费扣除仪器设备购置费后各自乘以相同比例后计算得出，计算比例依据“资金办法”相关规定执行。
3. 项目经费分阶段拨付，基金委下达年度经费(含直接经费和间接经费)到账后30日内，甲方将经费按比例拨付给乙方。
需要注意的是，具体的资金分配方案需要根据合作协议的约定，以及项目经费的管理办法来确定。
国自然结题后可以调整经费吗
国家自然科学基金间接经费比例2012年是百分之二十。根据查询国家自然科学基金间接费用政策可以得知，第八条规定“项目资金分为直接费用和间接费用”，首次设立“间接费用”开支科目，明确实施间接成本补偿机制，开启了国家自然科学基金项目资金管理改革的序幕，科学基金间接费用约占总经费的百分之20。
国家自然科学基金网络信息系统如何查间接费
可以。
可以重新做预算，两年内按照用于科研项目支出。
根据科学基金项目资助方式的不同，项目预算表分为定额补助式预算表和成本补偿式预算表。重大项目和国家重大科研仪器研制项目填报成本补偿式预算表，其他各类科学基金项目填报定额补助式预算表。定额补助式预算表包括《国家自然科学基金项目预算表（定额补助）》和《预算说明书（定额补助）》。成本补偿式预算表包括《国家自然科学基金项目预算表（成本补偿）》、《预算说明书（成本偿）》、《合作研究资金预算明细表（成本补偿）》、《设备费预算明细表（成本补偿）》、《测试化验加工费预算明细表（成本补偿）》和《劳务费预算明细表（成本补偿）》。项目申请人应结合项目批准金额，按照研究实际需要合理填写各科目预算金额，只编报直接费用预算，间接费用按依托单位单独核定。
总经费：直接+间接，间接费请登录基金委系统查询总额，因新立项项目国家基金委尚未核定项目间接经费，故间接费总额、间接费用（浙大）、合作单位经费-间接费用均暂为“0”。
（进入基金委系统——查询与统计——项目信息查询——批准项目综合查询——项目年度“选择全部”——点击查询——点击某个立项项目名称（显示蓝字）弹出对话框——间接费用拨款计划，可查看负责人所有国家基金项目总间接费、及其拨款状态、拨款计划等。）
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希望本篇文章《国家自然基金项目合作单位资金如何分配》能对你有所帮助！
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